La Misión de San Bruno fue el primer asentamiento misionero en la península de Baja California. Situada a 32 km al norte de Loreto, fue fundada en 1683 en un fuerte ubicado sobre una colina estratégica cercana a la bahía por el padre Eusebio Kino (Eusebio Franz Kühn o Eusebio Francesco Chini), originario del Tirol Romano.

El padre Kino llegó a esa zona con la expedición del almirante español Isidoro de Atondo y Antillón, y su intención original era la de fundar una misión en la bahía de La Paz, lo que no fue posible por los conflictos que se suscitaron con los indios Pericúes y Guaycura asentados ahí.
Una segunda expedición llegó el 7 de octubre, día de San Bruno, a un asentamiento de los indios Cochimíes, donde sí se logró establecer la misión. Sin embargo, la falta de alimentos y agua potable para la población, así como las epidemias, obligaron a los jesuitas a abandonarla en 1685.
Doce años después, en 1697, fundaron la primera misión permanente en Loreto.

En 2014, sobre la colina, sólo pueden verse algunos fragmentos de muro.