An einem der seltenen Wüstenflüsse der Baja California gelegen, war sie von fruchtbarem Land umgeben. Ein perfektes Bewässerungssystem steigerte die Erträge aus der Landwirtschaft und so lebten zeitweise bis zu 2000 Seelen in der Mission. Die Bevölkerung wurde jedoch immer wieder zum Opfer von eingeschleppten europäische Krankheiten wie Masern und Pocken. Bis 1768 hatte sich die Zahl  der Überlebenden auf weniger als 100 reduziert.

1770 wurde die Mission vom Orden der Franziskaner übernommen. Die Restaurierung der steinernen Mission begann Anfang des 20. Jahrhunderts.